在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
伯伦希尔魔法学院的教授永乐在图书馆偶遇了一只叫灰羽的精灵，得知精灵都是有愿望未完成才会留在世间，永乐决定帮灰羽完达成愿望。因为灰羽喜欢听永乐读书，永乐便经常与灰羽挑灯夜读，灰羽也一直听得兴致盎然，一人一精灵相处好不融洽。可没想到当永乐帮助灰羽实体化之后，灰羽竟然性情大变，为了让灰羽不再继续黑化，永乐不得不让灰羽消失在世间……
解开封印的绝世王者古玄尘，终于踏上了修行之途，在不断修炼变强的途中，他也了解到自己真正的身世，面对残酷的真相，古玄尘并不怨天尤人，他只愿以手中剑破除世间一切不公不义！他来到更广阔的世界，面对更强的敌人，演绎更辉煌的热血传奇！
