とある田舎の中学校で、ある男女が永遠の友情を誓い合った。 １つの夢に向かい運命共同体（しんゆう）となった二人の仲は―― 特に進展しないまま２年の歳月が過ぎる……！ 未だに初恋がこない陽キャ女子?犬塚日葵と、花を愛する植物系男子?夏目悠宇は、 高校２年生になっても変わらず、二人だけの園芸部で平和に親友をやっていた。 ところが、悠宇が過去の初恋相手と再会したことで、突如二人の歯車が狂い出す!? 果たして恋を知った日葵は〈理想の友だち〉脱却なるか？
ここが、私たちの居場所だから 数千を超える学校で形成された巨大な学園都市「キヴォトス」。 ここでは銃を手にした生徒たちの諍いが、日常的な風景になっている。 その中で、砂に包まれた「アビドス高等学校」は廃校の危機に瀕していた。 状況を脱すべく奮闘する「対策委員会」の5人の生徒が、 「先生」と呼ばれる“大人”と出会い、物語は動き始める。
