とある田舎の中学校で、ある男女が永遠の友情を誓い合った。 １つの夢に向かい運命共同体（しんゆう）となった二人の仲は―― 特に進展しないまま２年の歳月が過ぎる……！ 未だに初恋がこない陽キャ女子?犬塚日葵と、花を愛する植物系男子?夏目悠宇は、 高校２年生になっても変わらず、二人だけの園芸部で平和に親友をやっていた。 ところが、悠宇が過去の初恋相手と再会したことで、突如二人の歯車が狂い出す!? 果たして恋を知った日葵は〈理想の友だち〉脱却なるか？
ここが、私たちの居場所だから 数千を超える学校で形成された巨大な学園都市「キヴォトス」。 ここでは銃を手にした生徒たちの諍いが、日常的な風景になっている。 その中で、砂に包まれた「アビドス高等学校」は廃校の危機に瀕していた。 状況を脱すべく奮闘する「対策委員会」の5人の生徒が、 「先生」と呼ばれる“大人”と出会い、物語は動き始める。
不死者之魔王雷欧尼斯为了日后将会迎来的决战而将自身的灵魂封印了。 然而他在1000年后再度醒来时，不知为何却变成了10岁少年的模样！？ 被隶属于〈圣剑学院〉的美少女利瑟莉娅所保护的雷欧尼斯，在对这个变得截然不同的世界一头雾水的情况下，在〈圣剑学院〉入学了。 未知的敌人〈Void〉、〈第07战术都市〉、外观观是武器形态却拥有异能之力的〈圣剑〉。 在魔法被遗忘的这个未来世界，最强魔王与美少女们交织而成的圣剑与魔剑的学园幻想物语盛大开幕！
